La commission vétérinaire a pour tâche de veiller à l'application des dispositions relatives à la santé des chevaux, à leur protection contre les maladies et épizooties, aux vaccinations.
Elle doit également concourir à l'établissement des livres signalétiques d'identification en liaison avec le service des haras du ministère de l'agriculture et exerce le contrôle antidopage prévu par la loi (cf annexe 2 du règlement intérieur).